תוֹכֶן
| גרסה (נכון ל -29 / 6/2016) | 9 |
| פלטפורמות | |
| רישיון | קוד פתוח |
| קטגוריה | מדעי |
| מידע נוסף (בקר באתר של בעל האתר) |
| דירוג: 2.8 / 5 (6 קולות) |
סקירת תוכנה
תכונות עיקריות
- תומך בפורמטים שונים של גנום כגון GenBank ו- FASTA
- אינטראקציה עם נתונים עם זום ואנימציות panning
- גישה וטעינה של גנומים מאתרי QuickLoad
- להפוך נתונים לטפסים גרפים שונים
- שתף נתונים עם משתפי פעולה דרך Dropbox
- התקן תוספים עבור פונקציונליות נוספת
משולב דפדפן הגנום (IGB) היא תוכנית קוד פתוח המשמש להציג ולחקור datasets גנומי גדול. תוכל להציג פורמטים שונים של נתונים, ליצור אינטראקציה עם הנתונים שלך, ליצור תרשימים, לשמור את המידע שלך כתמונות ולשתף את הנתונים שלך עם משתפי פעולה.
IGB מאפשר לך להציג נתונים מ ביאורים ו sequences מיושר. התוכנית תומכת במגוון פורמטים כגון FASTA, BAM, BEDGRAPH, BigWIG, Cytoband ו- GenBank. אתה יכול לקחת נתונים ולהפוך אותו למגוון של גרפים טפסים, כולל גרפים לא תואמים עבור הדגשת הבדלי נתונים וגרפים עומק עבור הצגת כיסוי. ניתן גם לקיים אינטראקציה עם הנתונים שלך באמצעות IGB של התקרבות ואנימציות panning.
IGB מאפשר לך לגשת ולטעון גנומים מאתרי QuickLoad, שהם מערכות פשוטות של ספריות, רצפים וקובצי נתונים אחרים למטרות הדמיה. IGB מספק פונקציונליות מתקדמת עם תמיכה plugin כדי להוסיף פונקציונליות ואוטומציה זרימת עבודה באמצעות סקריפטים. IGB גם נותן לך תכונות מתקדמות לשיתוף הנתונים שלך, בין אם זה יהיה לפרסם את זה כמו JPEG באיכות גבוהה, PNG, או תמונה SVG או אחסון נתונים Dropbox לתת משתפי פעולה שלך גישה לפרויקט שלך.
IGB משמש בעיקר על ידי חוקרים באוניברסיטה, ביולוגים, וביואינפורמטיקה. הוא מספק כלים מתקדמים לפתיחת מגוון של פורמטים של נתוני הגנום, הצגת נתונים כגרפים שונים ושיתוף נתונים עם משתפי פעולה. למרבה הצער, התוכנית מסתמכת על מענקים להמשך הפיתוח, כלומר תמיכה ביישום יכול להפסיק בכל עת. עם זאת, דפדפן משולב הגנום הוא עדיין מסוגל, תוכנית להתאמה אישית עבור משתמשים המעוניינים לחקור ולנתח את נתוני הגנום שלהם.
סוגי קבצים נתמכים
סיומת קובץ ראשיים
.XML - קובץ XMLסיומות קבצים אחרים בשימוש על ידי דפדפן משולב הגנום 9
| סוגי קבצים נתמכים | |
|---|---|
| .מיטה | UCSC BED ביאור קובץ מעקב |
| .DAS | מושב ניתוח DeltaMaster |
| .FA | קובץ FASTA מעוצב |
| .FAS | קובץ רצף FASTA |
| .FASTA | קובץ רצף FASTA |
| .GB | קובץ נתונים GenBank |
| .SGR | SGR קובץ נתונים הגנום |
| .USEQ | קובץ הנתונים של הגנום USeq |
